Pada hari Rabu, tanggal 27 Juli 2022 telah dilaksanakan kegiatan pengangkutan Limbah dari TPS (Tempat Penyimpanan Sementara) Limbah B3 Balai Besar POM di Yogyakarta oleh PT.TLI (Teknotama Lingkungan Internusa), selaku penyedia pengelola Limbah B3. Pengelolaan limbah dilakukan sesuai prosedur sejak dari penghasil limbah, saat penyimpanan di TPS Limbah B3 dan dilanjutkan pengangkutan oleh penyedia pengelola limbah B3.
Sesuai ISO/IEC 17025 : 2017, Klausul 6.3 Fasilitas Laboratorium dan Kondisi Lingkungan, Laboratorium Pengujian Balai Besar POM di Yogyakarta memiliki kewajiban dalam mengelola limbah B3 yang telah dihasilkan. Limbah yang dihasilkan oleh BBPOM di Yogyakarta diantaranya limbah sisa analisa, limbah kemasan bekas B3, minyak pelumas bekas, baterai bekas, limbah elektronik, kemasan bekas tinta dan kain majun bekas. Limbah-limbah tersebut dikumpulkan dan dikelompokkan berdasarkan identitasnya di TPS Limbah B3. Limbah yang ada di TPS Limbah B3 akan diangkut oleh penyedia pengelola limbah B3 dalam jangka waktu yang telah direncanakan. Pengelolaan limbah B3 BBPOM di Yogyakarta juga telah dilaporkan secara rutin setiap bulan ke DLH Kota melalui aplikasi SILALING (Sistem Informasi Kelola Lingkungan Dinas Lingkungan Hidup Kota Yogyakarta.